Termometar za bazalnu tjelesnu temperaturu koristi se za mjerenje tjelesne temperature osobe odmah nakon jutarnjeg buđenja. U usporedbi s dnevnom tjelesnom temperaturom, na bazalnu tjelesnu temperaturu manje utječu okolišni čimbenici kao što su vježbanje ili prehrana. Ovo je korisno za otkrivanje suptilnih dnevnih promjena u tjelesnoj temperaturi, kao što su tijekom ovulacije ili promjene u funkciji štitnjače.
Termometri za staklenu groznicu imaju minimalnu ljestvicu od 0,2 stupnja F (0,1 stupanj), dok bazalni termometri zahtijevaju točnost od najmanje 0,1 stupanj F (0,05 stupnjeva). Stoga se stakleni bazalni termometri za tijelo prodaju odvojeno od običnih staklenih termometara za temperaturu. Međutim, svi elektronički toplomjeri imaju točnost od najmanje 0,1 stupanj F (0,05 stupnjeva) i stoga se mogu koristiti kao bazalni termometri za tijelo. Neki digitalni toplomjeri posebno su označeni kao 'bazalni termometri' i imaju posebne značajke, poput velikog zaslona, dodatnih memorijskih funkcija ili zvučnih smjernica za ispravno postavljanje.
